Информационно-образовательнный портал
для врачей при поддержке ведущих
медицинских вузов Санкт-Петербурга
Информационно-
образовательнный
портал для врачей

Визуально интерпретируемый, основанный на словарях подход к визуализации-геномному моделированию, с глиомой низкого уровня в качестве примера

Kuthuru S, Deaderick W, Bai H, Su C, Vu T, Monga V, Rao A,

РЕЗЮМЕ

Радиомикс — это быстрорастущее поле, в котором изометрические изображения извлекаются из изображений радиологии, чтобы предсказать клинические результаты / ответы, генетические изменения и другие результаты, относящиеся к прогнозу пациента или реакции на терапию. Такой подход может эффективно захватывать фенотипическую гетерогенность внутрипроцесса путем опроса «большего» поля изображения, что невозможно при использовании традиционных процедур биопсии, которые опросили только отдельные субрегионы. Большинство моделей в радиотехнике получают многочисленные функции изображения (например, текстуру, форму, размер) из набора данных радиологии, а затем изучают сложные нелинейные гипотезы для решения заданной задачи прогнозирования. Это представляет собой задачу визуальной интерпретации радиометрических характеристик, необходимых для эффективного внедрения радиомических моделей в процесс принятия решений в клинических условиях. С этой целью мы использовали метод изучения словаря для получения визуально интерпретируемых функций визуализации, имеющих отношение к генетическим изменениям в низкосортных глиомах. Эта модель может идентифицировать области медицинского изображения, которые потенциально влияют на процесс прогнозирования. Используя общедоступный набор данных изображений с магнитно-резонансной томографией у пациентов с диагнозом низкосортных глиом, мы продемонстрировали, что модель на основе словаря хорошо работает при прогнозировании 2 представляющих интерес биомаркеров (1p / 19q-код и мутация IDH1). Кроме того, визуальные области (атомы), связанные с этими словарями, показывают связь с основными молекулярными путями, участвующими в глиомагнезисе. Наши результаты показывают, что изучение словарей — это многообещающий подход для получения информации о диагностическом процессе и потенциальной помощи радиологам в выборе физиологически значимых мест биопсии.

 

Полный текст:

journals.sagepub.com

europepmc.org

www.ncbi.nlm.nih.gov