Информационно-образовательнный портал
для врачей при поддержке ведущих
медицинских вузов Санкт-Петербурга
Информационно-
образовательнный
портал для врачей

Система рестрикции ограничения типа II в штамме Ureaplasma parvum OMC-P162

Wu HN, Nakura Y, Yoshimura M, Gaddi Tantengco OA, Nomiyama M, Takayanagi T, Fujita T, Yasukawa K, Yanagihara I,

РЕЗЮМЕ

Уреаплазма parvum serovar 3 штамм, OMC-P162, был выделен из плаценты человека досрочной доставки на 26 неделе беременности. В этом исследовании мы секвенировали полный геном OMC-P162 и сравнивали его с другими сероварными 3 штаммами, выделенными у пациентов с различными клиническими состояниями. Было идентифицировано десять уникальных генов в OMC-P162, пять из которых были закодированы для гипотетических белков. Из них гены UPV_229 и UPV_230 сформировали оперон, чьи открытые рамки считывания были предсказаны для кодирования ДНК-метилтрансферазы и гипотетического белка соответственно. Анализ ДНК-модификации генома OMC-P162 идентифицировал N4-метилцитозин (m4C) и N6-метиладенин (m6A), но не 5-метилоцитозин (m5C). Рекомбинантный белок UPV230 проявлял активность эндонуклеазы и распознавал последовательность CATG, что приводило к тупому разрезу между A и T. Активность рестрикционного фермента была идентична активности культивируемого штамма OMC-P162, предполагая, что этот рестрикционный фермент естественным образом выражен в OMC-P162 , Мы обозначили этот фермент как UpaP162. Обработка плазмиды pT7Blue рекомбинантным протеином UPV229 полностью блокировала активность рестрикционного фермента UpaP162. Эти результаты свидетельствуют о том, что гены UPV_229 и UPV_230 действуют как система рестрикционной модификации типа II в Ureaplasma OMC-P162.

 

Полный текст:

dx.plos.org