Информационно-образовательнный портал
для врачей при поддержке ведущих
медицинских вузов Санкт-Петербурга
Информационно-
образовательнный
портал для врачей

Профилирование circRNA и miRNA радиационно-индуцированного повреждения пищевода в модели крысы

Ло J, Чжан C, Чжан Q, An F, Чжу W, Цзян Х, Ма C,

РЕЗЮМЕ

Доказательства также показали, что микро рибонуклеиновая кислота (miRNA) играет важную роль во многих клеточных процессах. Однако неясно, как ионизирующее излучение приводит к изменению уровней экспрессии miRNA и циркулярной рибонуклеиновой кислоты (circRNA) и как это изменение относится к травме пищевода. Мы проанализировали данные о секвенировании РНК (РНК-seq) из нормальной ткани пищевода и облученных тканях пищевода и использовали вычислительные подходы для идентификации и характеристики дифференцированных экспрессируемых miRNAs и circRNAs. Мы обнаружили 27 miRNAs и 197 circRNAs, которые имели значительно различные уровни экспрессии после обработки ионизирующим излучением по сравнению с нормальным контролем. По 27 miRNAs 7 miRNAs были отрегулированы, а остальные 20 были отрегулированы. Было обнаружено, что их целевые гены участвуют в ответах на биосинтез раны, липидов, пролиферацию клеток, миграцию клеток, активность хемокинов, связывание шпилек и клеточную мембранную систему. Мы также нашли 197 дифференциально выраженных циркулярных РНК, из которых 87 были отрегулированы и 110 были отрегулированы. Примечательно, что мы обнаружили, что дифференциально выраженные circRNAs были обогащены клеточной дифференциацией, миграцией эпителиальных клеток, развитием стриатума, связыванием белка, внеклеточной экзосомой и функциями фокальной адгезии. Из связанных с этим процессов метаболизм сфинголипидов был заметным. Многие из дифференцированных экспрессированных кРНК были вовлечены в пути метаболизма сфинголипидов. Клетки реагировали на ионизирующее излучение (ИР) с использованием нескольких путей, что приводило к метаболизму сфинголипидов и другим иммунным реакциям, что в конечном итоге приводило к травмам пищевода. Изначальное повреждение пищевода заслуживает изучения, особенно динамическая сеть circRNA и miRNA. Зная регуляторные детали связанных путей, можно предотвратить радиационное повреждение пищевода, а эффективность лучевой терапии может быть повышена.

 

Полный текст:

dx.doi.org

europepmc.org

www.ncbi.nlm.nih.gov