Qiao M, Ding J, Yan J, Li R1, Jiao J, Sun Q
РЕЗЮМЕ
ПРЕДПОСЫЛКИ / ЦЕЛИ:
Циркулярные РНК (circRNAs) являются эволюционно сохраняющимися циркулярными некодирующими РНК, которые играют определенную роль в нескольких заболеваниях путем секвестрации (протыкания) микроРНК (miRNAs). Однако их роль в псориазе остается неясной. В настоящем исследовании мы исследовали экспрессию circRNAs и проанализировали их потенциальные функции при псориазе.
МЕТОДЫ:
Массив цефной человеческой группы SBC V1.0 использовался для анализа экспрессии circRNA в псориатических поражениях и нормальных здоровых тканях кожи. Функциональный анализ проводили с использованием анализа генов онтологии (GO) и Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG). Предполагаемые элементы ответа miRNA (MREs) были идентифицированы с использованием программного обеспечения для прогнозирования целей miRNA. Шесть upregulated circRNAs были проверены количественной цепной реакцией обратной транскрипционной полимеразы в реальном времени при псориатических поражениях и здоровых тканях кожи.
РЕЗУЛЬТАТЫ:
В общей сложности было зарегистрировано 4956 circRNAs (3016 upregulated и 1940 downregulated, изменение смены ≥2 и p <0,05) были идентифицированы как дифференциально выраженные при псориазе. Кроме того, 4405 MRE были идентифицированы среди дифференциально выраженных circRNAs. hsa_circ_0061012 был повышен в псориатических поражениях по сравнению с нормальными здоровыми тканями кожи. Пять лучших MRE hsa_circ_0061012 были hsa-miR-7157-5p, hsa-miR-4769-3p, hsa-miR-6817-5p, hsa-miR-4310 и hsa-miR-6882-3p. Анализ GO был проведен для исследования биологических функций, обогащенных среди активированных мишеней пяти miRNAs при псориазе. Анализ GO показал, что большинство из 30 лучших обогащенных GO соединений связано с псориазом.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ:
hsa_circ_0061012 может стать кандидатом биомаркера псориаза. Результаты дают новую перспективу для лучшего понимания регуляции гена, основанного на ceRNA, при псориазе, и дают новую теоретическую основу для дальнейших исследований функции circRNA при псориазе.
© 2018 Автор (ы). Опубликовано С. Каргер А.Г., Базель.
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА:
Церна; CircRNA; Псориаз; элемент ответа miRNA; микроРНК
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30278433