Dou F, Zhou Z, Yang N, Zhong J, Pan J, Liu Q, Zhang J, Wang S,
РЕЗЮМЕ
Фон. Helicobacter pylori (H. pylori) является одной из наиболее частых и стойких бактериальных инфекций, которые затрагивают почти половину населения мира. Антибиотикорезистентность — это постоянно развивающийся процесс, и местный эпиднадзор за резистентностью к антибиотикам необходим для руководства врачами по выбору терапии. Целью этого исследования было установить обнаружение на основе микрочипов для идентификации инфекции H.pylori, кларитромицина и левофлоксацина, а также генетического полиморфизма CYP2C19 и руководства к потенциальному выбору ингибитора протонного насоса (PPI), введения антибиотика для индивидуальной эрадикации H.pylori терапия.
Методы. Анализируя последовательность генома человека CYP2C192 и CYP2C193 и мутации в областях гена 23S рРНК и gyrA, придавая устойчивость к кларитромицину и левофлоксацину, соответственно, мы разработали микрочип для индивидуальной терапии, выявляющий инфекцию H.pylori. Плазмиды были установлены как положительные или контрольные образцы для определения уровня (LOD). Была выполнена специфичность и чувствительность микрочипа. И было обследовано в общей сложности 1083 образцов биопсии желудка, и значение Kappa было рассчитано между матрицей и секвенированием Sanger. Мы также проанализировали устойчивость к кларитромицину и левофлоксацину в Китае, а также полиморфизмы CYP2C19.
Результаты. LOD для обнаружения H. pylori составлял 103 КОЕ / мл, а ДНК-геном человека составляла 2 нг / мкл. Результаты обнаружения 1083 образцов биопсии желудка показали, что 691 (63,80%) были H. pylori положительными, из которых 266 (38,49%) были резистентны к кларитромицину, 192 (27,79%) были устойчивы к левофлоксацину и 61 (8,83%) были устойчивы к обоим из них. Для типа полиморфизма CYP2C19 412 (38,04%) были гомозиготными быстрыми типами (HomEM), 574 (53%) были гетерозиготными EM (HetEM), а 97 (8,96%) были плохим метаболизатором (PM). Выводы. Предложенное обнаружение на основе микрочипов обладает высокой специфичностью, чувствительностью и воспроизводимостью для обнаружения устойчивости кларитромицина или левофлоксацина, а также полиморфизма CYP2C19, что может помочь улучшить клиническую скорость эрадикации H. pylori.
Полный текст:
dx.doi.org
europepmc.org
www.ncbi.nlm.nih.gov