Liang WS, Dardis C, Helland A, Sekar S, Adkins J, Cuyugan L, Enriquez D, Byron S, Little AS,
РЕЗЮМЕ
Chordoma — редкий рак сироты, возникающий из эмбриональных предшественников кости. Хирургия и лучевая терапия (RT) обеспечивают превосходный местный контроль, часто ценой значительной заболеваемости из-за вовлеченных структур и необходимостью относительно высоких доз RTare, которые обычно не являются целебными. однако рецидив остается высоким. Хотя наше понимание генетических изменений, происходящих в хордоме, быстро развивается, это знание еще не перешло в лечение. Мы провели комплексную ДНК (парная опухоль / нормальный весь эклог и мелкий цельный геном) и РНК (полный транскриптом опухоли) анализ секвенирования следующего поколения архивных сакральных и клинозных образцов. Включение транскриптомических данных позволило идентифицировать избыточную экспрессию гена и выраженные изменения ДНК и, таким образом, обеспечивало дополнительную поддержку для потенциальных терапевтических целей. У трех пациентов мы определили изменения, которые могут поддаваться лечению, одобренным FDA, для других типов опухолей. Эти изменения включают сверхэкспрессию FGFR1 (ponatinib, pazopanib) и дублирование количества CDK4 (palbociclib) и ERBB3 (гефитиниб) и мутацию V721G IGF1R (linsitinib, erlotinib). У третьего пациента была идентифицирована миссенс-мутация в IGF1R, что указывает на потенциальную активность для исследовательских стратегий против IGF1R. Наконец, у четвертого пациента не было выявлено никакого лечения. ДНК Ggermline продемонстрировала предсказанные патогенные изменения в CHEK2 и ATM, которые, возможно, предрасполагали пациента к развитию хордомы в молодом возрасте, а также могут быть связаны с потенциальной чувствительностью к ингибиторам PARP из-за недостатка в восстановлении гомологичной рекомбинации. Наши результаты показывают, что у пациентов с хордомой имеются аберрации в перекрывающихся путях. Эти результаты обеспечивают поддержку нацеливания на пути IGF1R / FGFR / EGFR и CDK4 / 6 в качестве стратегий лечения пациентов с хордомой. Это исследование подчеркивает ценность комплексного геномного и транскриптомического анализа в разработке рациональных, индивидуализированных планов лечения хордомы.
Полный текст:
molecularcasestudies.cshlp.org
assays.cancer.gov
antibodies.cancer.gov